More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12347 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  85.14 
 
 
148 aa  256  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  85.14 
 
 
148 aa  256  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  85.14 
 
 
163 aa  256  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  83.45 
 
 
148 aa  250  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  81.63 
 
 
156 aa  247  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  62.84 
 
 
148 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  54.42 
 
 
156 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  53.47 
 
 
148 aa  160  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  56.94 
 
 
156 aa  158  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  54.93 
 
 
152 aa  158  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 
152 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 
144 aa  157  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  53.9 
 
 
162 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 
148 aa  154  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  51.03 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 
151 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  51.03 
 
 
156 aa  150  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 
154 aa  127  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
145 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.88 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  38.84 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  35.95 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  34.67 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.8 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  32.41 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  37.7 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  39.34 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  36.8 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.39 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.79 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>