More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2809 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  61.38 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  59.59 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.39 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  59.15 
 
 		 148 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.45 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  54.11 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  56.64 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  54.17 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  46.58 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  39.71 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 186 aa  94  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 188 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 174 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.32 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  35.92 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.31 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>