More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2719 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 147 aa  236  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  54.42 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 170 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  41.32 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  37.16 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  31.15 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.87 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  34.4 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  34.4 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  36.18 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  28.19 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  31.15 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  31.15 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  31.15 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  33.9 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 152 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.52 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.46 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  34.43 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.13 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  36 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.4 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  31.71 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>