More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2138 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 149 aa  236  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 149 aa  236  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  53.06 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 170 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 170 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  34.43 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  34.43 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  29.51 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.03 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  29.51 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.33 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  29.51 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  29.51 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  34.88 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  35.33 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 161 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  34.96 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  34.43 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  32.52 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.36 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  33.05 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  35.97 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  34.71 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  32.52 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>