More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0987 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  309  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  48.59 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  47.3 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.33 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  38.57 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  41.04 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  38.56 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  42.54 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  42.34 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 182 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  40.46 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.46 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  41.98 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  41.8 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  38.76 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  31.72 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 182 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 182 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 182 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>