More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2318 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  100 
 
 		 151 aa  307  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 151 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  54.23 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2320  hypothetical protein  72.84 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 170 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 152 aa  116  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.54 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  41.04 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  40.3 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  34.59 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  40.46 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  40.46 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.81 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  36.69 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  36.69 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  36.57 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  36.57 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  36.57 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  32.61 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 136 aa  91.7  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.57 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  39.39 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  32.06 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>