100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2320 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2320  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  72.84 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  51.22 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  48.78 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  47.56 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  34.94 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  34.88 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  34.88 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  32.93 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  31.58 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  27.4 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  27.63 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.55 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  32.14 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.58 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  24.32 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  38.18 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.36 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  28.21 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 169 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 170 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 146 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>