More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2309 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  35.82 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.09 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.32 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.06 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  28.24 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  32.09 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  28.15 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.79 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0015  HTH-type transcriptional regulator LrpB  27.94 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  26.72 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  27.07 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4910  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.96 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  24.06 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  24.81 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0017  HTH-type transcriptional regulator LrpB  29.84 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  37.17 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  27.41 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  25.19 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.95 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  27.87 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>