More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1522 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
174 aa  351  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  82.18 
 
 
174 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  81.61 
 
 
174 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  81.03 
 
 
175 aa  297  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  81.03 
 
 
174 aa  297  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  80.46 
 
 
174 aa  295  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  77.59 
 
 
174 aa  293  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  32.48 
 
 
161 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  37.6 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  33.55 
 
 
229 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 
154 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
202 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
148 aa  91.3  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  32 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
160 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
160 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.2 
 
 
153 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
153 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  32.89 
 
 
229 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  31.64 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
159 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
161 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  30.57 
 
 
158 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
162 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
163 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
156 aa  88.2  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  32.7 
 
 
160 aa  87.8  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
144 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 
176 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
150 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.85 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
149 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
150 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
156 aa  85.9  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
156 aa  85.1  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  84.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 
159 aa  84.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  29.17 
 
 
153 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
150 aa  84.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
153 aa  84.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
146 aa  84.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
145 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
157 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
162 aa  84  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  28.47 
 
 
153 aa  84  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  35.66 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  30.57 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  35.66 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>