More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0918 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  93.68 
 
 		 174 aa  332  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  88.51 
 
 		 174 aa  328  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  90.23 
 
 		 174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  86.78 
 
 		 174 aa  311  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  80.46 
 
 		 174 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  81.03 
 
 		 174 aa  297  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  51.02 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  38.97 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  30.57 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 156 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 153 aa  88.6  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.04 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 145 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 156 aa  87.4  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.47 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 157 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  34.04 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 154 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 		 143 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  34.72 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  32.64 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  35.04 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  35.04 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  28.48 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  28.48 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  30.97 
 
 		 160 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  28.48 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 166 aa  84.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  28.48 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  32.19 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  32.19 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  32.19 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  32.19 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  33.57 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>