More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B0017 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0017  HTH-type transcriptional regulator LrpB  100 
 
 
142 aa  296  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4910  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
140 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0015  HTH-type transcriptional regulator LrpB  45.65 
 
 
140 aa  140  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  32.85 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  35.2 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
148 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  31.36 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  32.81 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  32.81 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.68 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.8 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  31.2 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  31.2 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  31.2 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  25.74 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  31.2 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0142  putative transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  37.3 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.01 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  37.3 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  37.3 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  28.8 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  28.8 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1753  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0144  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  27.21 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  28.1 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  36.79 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  30.58 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  28.87 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  28.15 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  28.1 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  27.4 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  24.6 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2693  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.63 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0495669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  28.8 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>