More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3379 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  310  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  91.19 
 
 		 159 aa  286  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  60.76 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  55.41 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  53.55 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 179 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  50.69 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  47.13 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  46.9 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.92 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  46.1 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  43.06 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 134 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 168 aa  97.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 150 aa  94  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  36.91 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  37.93 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.77 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  34.84 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  35.48 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  34.84 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 150 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 150 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 154 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  35.66 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  33.57 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  36.31 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  38.19 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>