More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2171 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  100 
 
 		 157 aa  313  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  65.16 
 
 		 179 aa  207  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 180 aa  190  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  60.9 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  58.16 
 
 		 171 aa  150  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.61 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  50.32 
 
 		 203 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 		 168 aa  138  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 174 aa  126  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  46.94 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.75 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  44.22 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 		 173 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.19 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  42.15 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  38.58 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  38.58 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  36.89 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  39.67 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.67 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  37.8 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  33.11 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  34.27 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  39.67 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  39.67 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>