More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4086 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  64.14 
 
 		 203 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.9 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 159 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  54.9 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  56.03 
 
 		 171 aa  150  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  54.61 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  51.3 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  39.13 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  40.15 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  40.15 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  36.3 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 154 aa  101  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 171 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 154 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  42.97 
 
 		 134 aa  97.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  34.03 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  37.68 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 156 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  37.69 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  37.69 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 161 aa  94.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 229 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  35.86 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>