More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5540 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  61.15 
 
 		 159 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 159 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  56.73 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.14 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  52.38 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 		 171 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 168 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  50.32 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  51.41 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  44.72 
 
 		 153 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 155 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.24 
 
 		 165 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 154 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 160 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 161 aa  101  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  32.9 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 154 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 152 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 150 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 152 aa  98.2  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 154 aa  98.2  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 154 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 152 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 157 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 152 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 152 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  38.51 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 157 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 154 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 156 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 157 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  25.52 
 
 		 157 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 150 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 156 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 152 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 157 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.75 
 
 		 155 aa  95.5  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 150 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 162 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 162 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.77 
 
 		 156 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 166 aa  94.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 152 aa  94.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  94.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  39.84 
 
 		 134 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 156 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  39.42 
 
 		 152 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  39.42 
 
 		 152 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  39.42 
 
 		 152 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  39.42 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 156 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  31.29 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 157 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 152 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 154 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>