More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3951 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  43.24 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  42.47 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 203 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 156 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  33.6 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  33.09 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  32.12 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  38.18 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  34.65 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  34.13 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  34.13 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.85 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2178  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.83 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  35.78 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  30.16 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>