More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4349 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 152 aa  301  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  66.44 
 
 		 154 aa  197  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  61.44 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  52.08 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  55.8 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 171 aa  123  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 203 aa  123  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 168 aa  118  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  44.22 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.37 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 166 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 181 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  37.86 
 
 		 166 aa  97.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  33.1 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 176 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 157 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  33.8 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  33.8 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  33.8 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 155 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  37.16 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  37.16 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 		 172 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  36.49 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>