More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12792 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 180 aa  273  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 180 aa  273  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  75.44 
 
 		 171 aa  263  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  81.53 
 
 		 157 aa  258  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  65.16 
 
 		 157 aa  207  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  58.43 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.03 
 
 		 169 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  51.27 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  52.11 
 
 		 171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  50.32 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 		 158 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 155 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  38.78 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 173 aa  97.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  33.11 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 158 aa  94.4  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 153 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 156 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.97 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  31.54 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 154 aa  91.3  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 154 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 159 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 156 aa  90.9  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  34.03 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 		 229 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 154 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 155 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  88.6  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 202 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 152 aa  88.2  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 160 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 159 aa  87.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 155 aa  87.4  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>