More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4335 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 173 aa  344  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  55.4 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 157 aa  150  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  49.01 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  44.6 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.58 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  41.38 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 158 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  33.56 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 163 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  40.34 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  40.34 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 155 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  41.53 
 
 		 134 aa  85.1  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 155 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 152 aa  84.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 150 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  42.59 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  31.88 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  37.72 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  32.37 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  26.71 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  30 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>