More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0557 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  318  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  70.51 
 
 
156 aa  241  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  50.34 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 
156 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  45.64 
 
 
158 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
155 aa  147  6e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.13 
 
 
164 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.13 
 
 
164 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.13 
 
 
164 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
153 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
153 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
164 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
153 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.84 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
153 aa  133  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.38 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
153 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.47 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.47 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.76 
 
 
154 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.14 
 
 
153 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.5 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.47 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
153 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.1 
 
 
150 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  38.82 
 
 
154 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
152 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.46 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.46 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.46 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.46 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.46 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  35.57 
 
 
160 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 
159 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
172 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 
148 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
168 aa  94.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 
158 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
184 aa  94  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  35.56 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.97 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
153 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 
157 aa  87.8  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
162 aa  87  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
156 aa  87  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
156 aa  87  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.57 
 
 
188 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.94 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>