More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2359 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 167 aa  335  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  58 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 174 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  47.1 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 179 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 143 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  42.62 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.5 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.33 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 151 aa  94.4  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 148 aa  94  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 152 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 167 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 152 aa  87.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.3 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.14 
 
 		 144 aa  85.1  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  33.75 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 159 aa  84.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 149 aa  84  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.78 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3088  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.11 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  29.93 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.08 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>