More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1645 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  100 
 
 
148 aa  297  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  64.19 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  64.19 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  64.19 
 
 
163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 
148 aa  196  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  62.84 
 
 
148 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  62.76 
 
 
156 aa  192  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  61.38 
 
 
156 aa  184  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 
148 aa  176  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  52.41 
 
 
149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  54.23 
 
 
148 aa  159  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 
162 aa  157  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 
156 aa  157  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 
156 aa  156  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  52.11 
 
 
152 aa  153  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  52.82 
 
 
146 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  47.89 
 
 
154 aa  143  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  47.18 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  46.53 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.57 
 
 
144 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
158 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  36.36 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  38.4 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
174 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
174 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  36.52 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
174 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
163 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  31.72 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>