More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1007 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  326  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  82.32 
 
 		 164 aa  270  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  75 
 
 		 171 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  71.88 
 
 		 165 aa  236  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  73.65 
 
 		 171 aa  231  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  69.74 
 
 		 159 aa  220  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 173 aa  216  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  64.81 
 
 		 162 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 164 aa  213  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 173 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  66.46 
 
 		 162 aa  208  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 162 aa  205  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  64.24 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 176 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 176 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 176 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  61.07 
 
 		 168 aa  194  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  61.88 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  62.76 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  47.47 
 
 		 177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 		 163 aa  140  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 308 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 302 aa  94.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 360 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 299 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 296 aa  80.5  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  34.75 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.12 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.79 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.2 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.2 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.2 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.2 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 329 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.47 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.47 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 331 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  27.86 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.2 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  32.41 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.47 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.54 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.54 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.54 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.26 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.25 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.09 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>