More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3332 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.94 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 328 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 296 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  36.89 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  31.06 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 327 aa  63.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  27.97 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  32.77 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  33.07 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  34.95 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  23.7 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  28.1 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  29.69 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  25.76 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  29.55 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  29.17 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>