More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3779 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  323  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  83.95 
 
 		 162 aa  279  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 164 aa  230  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  73.79 
 
 		 159 aa  224  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  71.92 
 
 		 173 aa  221  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 173 aa  217  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  63.52 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 		 164 aa  208  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  68.03 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 176 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 176 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 176 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 161 aa  205  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  68.75 
 
 		 171 aa  203  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  68.03 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  67.36 
 
 		 171 aa  197  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  59.01 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  58.49 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  68.03 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 177 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 308 aa  95.5  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 360 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 299 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 302 aa  91.3  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 192 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  32.24 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.65 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 329 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  31.06 
 
 		 323 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  31.51 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 296 aa  70.9  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 		 331 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.81 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  27.27 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  32.88 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  34.65 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.09 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>