More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1373 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
360 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.35 
 
 
302 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  50.69 
 
 
308 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
165 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
173 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
164 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
162 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
164 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
176 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
176 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
176 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
173 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
161 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
162 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
159 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  26.02 
 
 
328 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
164 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
184 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.25 
 
 
171 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
177 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 
171 aa  85.9  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
168 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
165 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0364  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.34 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.09 
 
 
148 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
157 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 
149 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
148 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 
161 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 
167 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
156 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.47 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
173 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3605  AsnC family transcriptional regulator  34.82 
 
 
163 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.641359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  20.14 
 
 
148 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.97 
 
 
150 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
157 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 
151 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  32.58 
 
 
156 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
156 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 
157 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.09 
 
 
150 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
164 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  26.41 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
144 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.43 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
163 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
148 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
148 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
148 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
165 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 
146 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
157 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
170 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  51.67 
 
 
153 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
170 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  51.67 
 
 
153 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
184 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
163 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  50.82 
 
 
170 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 
154 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
145 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  33.62 
 
 
154 aa  53.5  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
155 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
162 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
153 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
152 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
152 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  33.62 
 
 
154 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
137 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
163 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
156 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
145 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
188 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
164 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
156 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
164 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
164 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
153 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
157 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.48 
 
 
153 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 
160 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>