More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0354 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
338 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 
323 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 
327 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  37.46 
 
 
485 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.03 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  34.34 
 
 
332 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
343 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
331 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  30.95 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.82 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
162 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
171 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
159 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.71 
 
 
171 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
162 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  34.81 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  36.97 
 
 
137 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  27.69 
 
 
140 aa  70.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 
137 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
137 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  25.08 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
140 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  38.68 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
184 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
173 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
174 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  31.82 
 
 
174 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  34.13 
 
 
291 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
174 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.57 
 
 
155 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
156 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  36.79 
 
 
137 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
148 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  29.06 
 
 
165 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
164 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
174 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
148 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  38.98 
 
 
156 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
152 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
159 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
156 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
140 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
140 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
148 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
140 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
177 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  29.06 
 
 
140 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.97 
 
 
153 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.5 
 
 
148 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
153 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.97 
 
 
153 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.66 
 
 
153 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.66 
 
 
153 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.17 
 
 
153 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.66 
 
 
153 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
144 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 
153 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
152 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 
153 aa  56.6  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
153 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 
164 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.72 
 
 
152 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.61 
 
 
153 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 
164 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 
164 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 
164 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.72 
 
 
152 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.72 
 
 
152 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.28 
 
 
153 aa  56.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  23.24 
 
 
143 aa  56.2  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
155 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.86 
 
 
152 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.15 
 
 
150 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28 
 
 
153 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  31.9 
 
 
153 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>