More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0418 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 137 aa  266  5e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  75.91 
 
 		 137 aa  214  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  72.99 
 
 		 137 aa  199  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  66.42 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  66.42 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.37 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 338 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 163 aa  67  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.39 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  33.9 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.17 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0907  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.36 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2693  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0495669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.08 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0142  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.79 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0144  putative transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.07 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.07 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.07 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.07 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.07 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.36 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.07 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.47 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.1 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  29.29 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.77 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.37 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 156 aa  57  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 175 aa  57  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.79 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.79 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>