More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0142 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0142  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
196 aa  393  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1753  putative transcriptional regulator, AsnC family  68.21 
 
 
196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0144  putative transcriptional regulator, AsnC family  66.01 
 
 
204 aa  259  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2693  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 
196 aa  174  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0495669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0907  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.88 
 
 
199 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  44.79 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  51.43 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0017  HTH-type transcriptional regulator LrpB  34 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4910  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0015  HTH-type transcriptional regulator LrpB  41.79 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
136 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  45.45 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
149 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  40.16 
 
 
154 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
149 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  38.52 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  46.38 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  44.93 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  32.56 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  38.4 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  36.52 
 
 
150 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  36.52 
 
 
150 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  33.01 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
151 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  40.22 
 
 
137 aa  61.6  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
151 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
152 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  41.25 
 
 
154 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
172 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
137 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  43.16 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  35.79 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  33.01 
 
 
152 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  48.57 
 
 
155 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  40.21 
 
 
153 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  48.57 
 
 
155 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
147 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
153 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
148 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  46.97 
 
 
153 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
167 aa  58.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
149 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
162 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.68 
 
 
148 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.14 
 
 
160 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  33.91 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  32.11 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
137 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 
145 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
162 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
143 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  29.82 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  29.82 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.44 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  40.3 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
141 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>