More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2301 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  299  9e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  84.21 
 
 		 152 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 152 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 151 aa  236  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  76.97 
 
 		 152 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  76.97 
 
 		 152 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  72.11 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.54 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  37.32 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  44.53 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.36 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  42.19 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 180 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.41 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  41.41 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.46 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  39.84 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 181 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 181 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 181 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 181 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 169 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1388  transcriptional regulator, AsnC family  42.62 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>