More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0166 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  276  5e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  85.4 
 
 		 142 aa  239  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.71 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  30.94 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  32.64 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  27.66 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  27.34 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  32.85 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  56.14 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.67 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.67 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.67 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  23.02 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  23.91 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>