More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5069 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  317  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  92.47 
 
 
148 aa  275  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  88.51 
 
 
163 aa  259  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  89.04 
 
 
148 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  89.04 
 
 
148 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  81.63 
 
 
148 aa  247  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  62.76 
 
 
148 aa  192  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  53.9 
 
 
156 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  54.17 
 
 
148 aa  163  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  54.11 
 
 
152 aa  160  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  54.11 
 
 
152 aa  160  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  51.01 
 
 
151 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  52.41 
 
 
149 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
144 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  53.19 
 
 
162 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  51.39 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 
154 aa  146  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  52.11 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
154 aa  120  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  39.72 
 
 
144 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 
145 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
174 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  35.83 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.25 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.8 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  33.57 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.88 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.8 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.88 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  34.29 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
175 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  37.29 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  37.29 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  37.29 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>