More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5148 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  79.87 
 
 
158 aa  260  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  67.97 
 
 
155 aa  220  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  60.81 
 
 
157 aa  191  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  55.33 
 
 
155 aa  184  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  48.98 
 
 
156 aa  156  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
156 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
156 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
156 aa  147  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.37 
 
 
153 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.7 
 
 
153 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.7 
 
 
153 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.71 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.71 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.71 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.03 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.06 
 
 
153 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.36 
 
 
153 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
153 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.36 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.71 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.36 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.36 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.36 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.36 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
154 aa  133  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.07 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.14 
 
 
152 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.07 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.05 
 
 
152 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.05 
 
 
152 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.05 
 
 
152 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.52 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  39.31 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.38 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.38 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.31 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  41.03 
 
 
160 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
149 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 
156 aa  100  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.69 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
170 aa  90.9  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
160 aa  90.5  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
163 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
162 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
148 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
162 aa  84  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
196 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>