More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1441 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
153 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.24 
 
 
153 aa  214  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
153 aa  213  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
153 aa  213  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
153 aa  213  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
153 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
153 aa  212  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
153 aa  211  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.35 
 
 
154 aa  210  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  66.44 
 
 
153 aa  207  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  66.44 
 
 
164 aa  206  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.12 
 
 
153 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.12 
 
 
164 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.12 
 
 
164 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 
153 aa  205  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.12 
 
 
164 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  66.44 
 
 
153 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 
153 aa  205  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 
164 aa  203  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 
153 aa  204  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 
164 aa  203  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 
164 aa  203  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 
153 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  203  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  61.9 
 
 
153 aa  202  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  202  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
152 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  64.38 
 
 
153 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  64.38 
 
 
153 aa  202  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  60.67 
 
 
154 aa  201  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  60 
 
 
154 aa  199  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  59.18 
 
 
153 aa  192  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  45.89 
 
 
156 aa  135  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  47.26 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
156 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  43.15 
 
 
155 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
156 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
155 aa  117  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
168 aa  103  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  35.46 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
159 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
155 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
174 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.65 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  35.59 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.67 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  34.33 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  31.67 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.07 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  26.95 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  29.61 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  31.09 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>