More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0737 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 		 153 aa  316  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  96.08 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  95.42 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  93.46 
 
 		 153 aa  299  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.81 
 
 		 164 aa  298  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 164 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 164 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.81 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 164 aa  298  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 153 aa  297  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 164 aa  296  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 164 aa  296  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 164 aa  296  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 		 153 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.81 
 
 		 153 aa  295  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  90.2 
 
 		 153 aa  291  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.51 
 
 		 153 aa  244  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  77.18 
 
 		 153 aa  243  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.84 
 
 		 153 aa  243  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 		 154 aa  240  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 153 aa  240  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 		 153 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 152 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 152 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 152 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 152 aa  234  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 		 152 aa  234  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.03 
 
 		 152 aa  234  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.03 
 
 		 152 aa  233  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  71.23 
 
 		 153 aa  223  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.36 
 
 		 153 aa  217  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  67.12 
 
 		 154 aa  212  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  66.44 
 
 		 154 aa  210  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.75 
 
 		 150 aa  205  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  46.21 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  42.07 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  35.42 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.62 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.59 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 184 aa  77  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.62 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  35.83 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.73 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>