More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0002 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
153 aa  314  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
153 aa  314  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
153 aa  314  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  91.5 
 
 
153 aa  290  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.93 
 
 
153 aa  277  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.27 
 
 
153 aa  275  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.93 
 
 
153 aa  274  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.31 
 
 
153 aa  269  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  83.55 
 
 
154 aa  266  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.09 
 
 
152 aa  265  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.09 
 
 
152 aa  265  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.09 
 
 
152 aa  265  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.43 
 
 
152 aa  263  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.43 
 
 
152 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.43 
 
 
152 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.77 
 
 
152 aa  260  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  239  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  239  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  239  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  239  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
164 aa  239  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  238  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  238  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  238  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
164 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
164 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
164 aa  238  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  237  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  237  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  235  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 
153 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.97 
 
 
153 aa  216  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  68.24 
 
 
154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  66.01 
 
 
153 aa  213  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.03 
 
 
150 aa  213  7e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.57 
 
 
154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  48 
 
 
157 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 
155 aa  141  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  43.45 
 
 
156 aa  138  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  43.15 
 
 
158 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  34.97 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  107  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
159 aa  103  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
156 aa  100  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
152 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.37 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  30.6 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  28.76 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  26.53 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>