More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4088 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  99.34 
 
 
152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  99.34 
 
 
152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  97.37 
 
 
152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  96.71 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  94.74 
 
 
153 aa  298  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  88.74 
 
 
153 aa  281  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  88.08 
 
 
153 aa  275  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  87.42 
 
 
153 aa  274  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  84.11 
 
 
154 aa  266  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  85.23 
 
 
153 aa  266  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.09 
 
 
153 aa  265  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.09 
 
 
153 aa  265  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  86.09 
 
 
153 aa  265  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  76.67 
 
 
153 aa  241  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.84 
 
 
164 aa  239  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.67 
 
 
153 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
164 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
164 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
164 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
153 aa  237  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
164 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
153 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
164 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
164 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.5 
 
 
153 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74 
 
 
153 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74 
 
 
153 aa  235  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.33 
 
 
153 aa  234  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  68.24 
 
 
153 aa  214  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  66.89 
 
 
153 aa  213  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  66.22 
 
 
154 aa  208  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.54 
 
 
154 aa  207  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  65.99 
 
 
150 aa  202  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  46 
 
 
157 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
156 aa  130  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
158 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  41.33 
 
 
156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 
155 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
156 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  35.62 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
149 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
159 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
168 aa  94  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
155 aa  84  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
156 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
174 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 
174 aa  82  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.09 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.05 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>