More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1012 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  55.26 
 
 
158 aa  190  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  55.33 
 
 
156 aa  184  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  57.24 
 
 
157 aa  183  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.03 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.03 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.03 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.71 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
156 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.37 
 
 
153 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.37 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.38 
 
 
153 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.06 
 
 
153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.38 
 
 
153 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.06 
 
 
153 aa  130  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.74 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
153 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.15 
 
 
150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.74 
 
 
153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.07 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.28 
 
 
153 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.57 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.57 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.57 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.57 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.57 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.28 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.4 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.28 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.28 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.28 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  36.73 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.28 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.58 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.58 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.58 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.58 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.89 
 
 
152 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
154 aa  123  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  41.89 
 
 
152 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  38.82 
 
 
153 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
154 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  36.62 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
168 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
150 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  30.13 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.15 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
167 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  26.57 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  29.27 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.61 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>