More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3441 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  333  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.24 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 177 aa  90.5  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.46 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  32.31 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  30.94 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 338 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 329 aa  73.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  30.22 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.65 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 299 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  25.85 
 
 		 291 aa  64.3  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  25 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>