More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3605 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
329 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.77 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
343 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  33.97 
 
 
323 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  36.68 
 
 
332 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  35.59 
 
 
296 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  30.57 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  30.03 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
346 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  31.44 
 
 
327 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
485 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  33.86 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  26.16 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
162 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
164 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.94 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  24.13 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  26.39 
 
 
156 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
159 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
164 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 
240 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
151 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  23.47 
 
 
360 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
157 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
146 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  26.9 
 
 
162 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
167 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
158 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
159 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
144 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
157 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
163 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  25.97 
 
 
155 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
164 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 
168 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.17 
 
 
171 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
163 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
163 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 
157 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
163 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 
152 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
161 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
181 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
181 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
172 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
181 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
181 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
154 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  22.92 
 
 
153 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
161 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
148 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
172 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
149 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
163 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
153 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
172 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  25.6 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
154 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
166 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
148 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
158 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
166 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
173 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
160 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  24.5 
 
 
156 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>