265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6860 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 485 aa  972    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  39.56 
 
 		 323 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  40.06 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  37.77 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 		 329 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  40.2 
 
 		 296 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.93 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  30.18 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  27.99 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.72 
 
 		 329 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  30.42 
 
 		 332 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.73 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 140 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  26.86 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 174 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 140 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  30.91 
 
 		 148 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 174 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 156 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.19 
 
 		 171 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  26.58 
 
 		 175 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 157 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 157 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 157 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  34.43 
 
 		 163 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  26.77 
 
 		 148 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  34.09 
 
 		 167 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 152 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 158 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 		 161 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 167 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 328 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 163 aa  53.5  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  29.69 
 
 		 165 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 181 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 181 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 157 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 163 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 163 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 153 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 181 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 181 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 163 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 145 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 155 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 162 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 171 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 159 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 152 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 162 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 173 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  23.84 
 
 		 308 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  27.49 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 163 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 157 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 172 aa  50.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  24.64 
 
 		 143 aa  50.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 168 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 155 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 163 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 163 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 163 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 140 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 145 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 163 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  29.33 
 
 		 158 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  26.62 
 
 		 152 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 145 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 152 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  25.33 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 152 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 		 150 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 147 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 155 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>