More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3111 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  51.56 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 338 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  44.82 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 485 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.59 
 
 		 329 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  37.21 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  35.91 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  29.77 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.06 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  31.54 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  25.35 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  28.11 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  26.98 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  25.81 
 
 		 165 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 157 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 161 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  26.95 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 171 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 152 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 181 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  53.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 152 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.47 
 
 		 171 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 		 156 aa  52.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 156 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 157 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 162 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 140 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 157 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  26.8 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  25.09 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 150 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  24.31 
 
 		 153 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 154 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 152 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 		 155 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>