More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1571 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
173 aa  353  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  94.8 
 
 
173 aa  338  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  88.44 
 
 
176 aa  295  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  88.44 
 
 
176 aa  295  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  88.44 
 
 
176 aa  295  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 
165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  69.86 
 
 
162 aa  217  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  67.74 
 
 
161 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.28 
 
 
164 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  67.95 
 
 
159 aa  214  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  69.8 
 
 
162 aa  213  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  67.81 
 
 
162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  62.35 
 
 
162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  71.03 
 
 
171 aa  210  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  71.23 
 
 
164 aa  210  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 
171 aa  205  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  62.5 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 
184 aa  192  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  64.19 
 
 
165 aa  183  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 
177 aa  160  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
360 aa  94.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
299 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
302 aa  89  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
308 aa  84.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  25.34 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.39 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
150 aa  72  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
328 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.33 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.28 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.71 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  27.59 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>