More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1420 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
302 aa  590  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  67.35 
 
 
360 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  51.18 
 
 
308 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
299 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  37.15 
 
 
291 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  32.98 
 
 
296 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
161 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
159 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
164 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
173 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
162 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
164 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
162 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
164 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
173 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  32.56 
 
 
184 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.06 
 
 
171 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
162 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
176 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
176 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
176 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  36.64 
 
 
177 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  25.56 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.59 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.67 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
157 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  27.69 
 
 
163 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  24.11 
 
 
148 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  34.4 
 
 
149 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0364  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.78 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.94 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
161 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.93 
 
 
152 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
148 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
141 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
148 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
148 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
162 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  35.61 
 
 
156 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
148 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 
163 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
144 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
157 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
143 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
156 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 
147 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
154 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 
149 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  53.23 
 
 
152 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
141 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
143 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 
157 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 
157 aa  55.8  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
155 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.6 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  35.93 
 
 
186 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
145 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0235  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
176 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
154 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1156  transcriptional regulator  34.82 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.675806  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.21 
 
 
157 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
160 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
167 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
141 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
147 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  29.55 
 
 
146 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 
165 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
159 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
156 aa  52.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  32.82 
 
 
148 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
175 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
156 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
170 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
170 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  34.52 
 
 
165 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
156 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
175 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>