More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0364 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0364  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0797  AsnC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0907  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.78 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  45.76 
 
 		 167 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0391  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  38.98 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2693  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.32 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0495669 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1753  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.76 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  47.27 
 
 		 154 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  19.79 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 157 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 154 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 161 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  39.73 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0144  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.37 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0142  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.3 
 
 		 196 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 149 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 143 aa  52.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  52.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 176 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 153 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 150 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.93 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  38.98 
 
 		 161 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  38.18 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  41.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  27.69 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 166 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 166 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 173 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.36 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  35.59 
 
 		 158 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 166 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.81 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  40.68 
 
 		 167 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 149 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 172 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 157 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 160 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  40 
 
 		 156 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>