More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1811 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  306  6.999999999999999e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0017  HTH-type transcriptional regulator LrpB  37.76 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  27.91 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  32.23 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  32.23 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  24.82 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  28.35 
 
 		 167 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.51 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  31.4 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  28.47 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  25.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  33.9 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.17 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  27.27 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  27.03 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0015  HTH-type transcriptional regulator LrpB  25.62 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4910  AsnC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.33 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  27.27 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 174 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  27.03 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>