More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0877 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
172 aa  340  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  99.42 
 
 
172 aa  338  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  99.42 
 
 
172 aa  338  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
168 aa  84.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  33.53 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  26.42 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  27.65 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.97 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3309  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0359106 
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  31.65 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  31.65 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.86 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 
332 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  27.1 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
140 aa  61.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  27.69 
 
 
343 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  28.47 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
143 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  35.96 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  33.98 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
329 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  32.21 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  27.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5214  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  32.28 
 
 
229 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  38.75 
 
 
137 aa  55.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  30.39 
 
 
329 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
202 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  32.28 
 
 
229 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  32.28 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  32.28 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
202 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  32.28 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  32.28 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
308 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
140 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.97 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
295 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  25.77 
 
 
323 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>