More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2503 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  356  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  32.08 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  30.91 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.62 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  37.61 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  34.55 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.38 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  38.33 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  36.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  27.1 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.02 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  27.07 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.71 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  29.93 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  26.97 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>