More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3706 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  325  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  97.53 
 
 		 184 aa  317  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 173 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3605  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.641359  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.73 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  29.03 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  28 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  28 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  28 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  30 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  30.14 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  27.74 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  27.33 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  28.3 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>