More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2860 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  307  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  57.43 
 
 
152 aa  184  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
152 aa  159  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  26 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
184 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.56 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.39 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.41 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  24.5 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.38 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  28.36 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  25.83 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.17 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  25.66 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  25.56 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
195 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  35.58 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.86 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  28.47 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  26.24 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 
172 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  30.39 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0468  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.674302  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>